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Révolutionner l'analyse des séquences biologiques : présentation du premier outil de recherche de modifications

Dans le domaine en constante évolution des produits pharmaceutiques et des biotechnologies, la précision et l'efficacité sont primordiales tout au long du processus de recherche et développement (R&D). Pour suivre le rythme des progrès rapides des sciences biologiques, il est impératif de trouver des solutions innovantes.  

Dans cet article, nous allons nous intéresser à la dernière nouveauté de Patsnap Bio, le premier outil de recherche de modifications chimiques au monde, et voir comment il peut améliorer les techniques de recherche de séquences et rationaliser l'analyse de la liberté d'exploitation (FTO).

Qu'est-ce que la modification de séquence ? 

La modification des séquences est essentielle au développement de médicaments et à la protection de la propriété intellectuelle (PI). Elle consiste à modifier une séquence de protéines ou d'acides nucléiques en ajoutant des groupes chimiques à des régions spécifiques, induisant ainsi des changements fonctionnels. Le marquage fluorescent, la glycosylation et la phosphorylation ne sont que quelques-unes des nombreuses techniques de modification disponibles pour obtenir des propriétés thérapeutiques optimales, telles qu'une biodisponibilité et une spécificité cible élevées, une demi-vie prolongée et des effets hors cible réduits. En comprenant les subtilités de la modification des séquences, les chercheurs peuvent naviguer plus efficacement dans les complexités du développement thérapeutique, ce qui leur permet en fin de compte de faire progresser la médecine et d'améliorer les résultats pour les patients.   

Image montrant une séquence nucléotidique modifiée trouvée dans le brevet US20180195070A1 : Compositions et méthodes pour inhiber l'expression génétique du LPA.
Exemple d'une séquence nucléotidique modifiée trouvée dans un brevet US20180195070A1 : Compositions et méthodes pour inhiber l'expression génétique du LPA.
source : Patsnap Bio

Établissement de la brevetabilité des séquences

Les recherches basées sur les séquences sont essentielles pour déterminer la brevetabilité de nouvelles séquences. Elles permettent de s'y retrouver dans le paysage actuel de la propriété intellectuelle et d'identifier les risques potentiels de contrefaçon. Dans des domaines tels que les technologies des acides nucléiques, l'utilisation stratégique de modifications chimiques est essentielle. Ces modifications jouent un rôle déterminant dans la conception de médicaments qui optimisent l'efficacité des oligonucléotides, les rendant ainsi viables pour lutter contre des maladies complexes.

Malgré son importance, l'absence de normalisation dans la description des modifications chimiques dans les brevets reste une lacune flagrante. Les descriptions des modifications dans les brevets sont souvent très individualistes : par exemple, 2'-O-méthyle et 2'-ome désignent tous deux la même modification de l'ARN ribosomique. Cela pose un défi pour la recherche de brevets pertinents à l'aide des méthodes de recherche traditionnelles et compromet la précision des recherches FTO.  

Pour surmonter cette difficulté, les chercheurs doivent recourir à toute une série de méthodes de recherche fastidieuses. Cela implique notamment de combiner les recherches traditionnelles par séquence avec des recherches exhaustives par mot-clé afin de saisir toutes les variations possibles d'une modification. Ils doivent ensuite examiner minutieusement, manuellement et élément par élément, les données de modification pour chaque séquence.  

Patsnap Bio élimine ces difficultés en offrant aux innovateurs un moyen de sélectionner et d'analyser plus rapidement et avec plus de confiance les données relatives aux modifications de séquences, grâce à l'intelligence artificielle. La nouvelle fonction de recherche de modifications permet aux utilisateurs de rechercher des modifications spécifiques à un site, avec ou sans séquence de requête, à partir d'une base de données contenant plus de 1,5 million de séquences modifiées. Cette fonctionnalité répond à des questions essentielles telles que : 

  • Dans quelle mesure cette modification est-elle utilisée ?   
  • Quelle technique antérieure existante contient cette modification ? 
  • Quelles autres modifications sont liées à ma requête ? 
GIF illustrant un flux de travail dans Patsnap où un utilisateur saisit la longueur de séquence souhaitée et l'emplacement/le type de modification.
Pour lancer une recherche, les utilisateurs n'ont qu'à saisir la longueur de séquence souhaitée et l'emplacement/le type de modification. Si nécessaire, une séquence de requête peut également être utilisée.  

En facilitant la récupération et la compréhension complètes des données relatives aux modifications de séquences, Patsnap Bio permet aux chercheurs, aux professionnels de la propriété intellectuelle et au personnel de R&D d'aborder efficacement la conception et l'optimisation de thérapies de classe mondiale. 

Caractéristiques principales

  • Bibliothèque de modifications standardisées : grâce à une IA avancée et à une sélection manuelle minutieuse, Patsnap Bio regroupe les données relatives aux modifications de séquences dans une bibliothèque standardisée. Ces données comprennent neuf catégories principales et 382 sous-catégories de types de modifications chimiques, garantissant ainsi une couverture complète. 
  • Options de recherche flexibles : offrant à la fois une option de recherche basée sur les séquences et une option sans séquences, la recherche de modifications de Patsnap Bio facilite l'identification des tendances et des informations relatives à une modification spécifique. Pour une requête basée sur les séquences, il est possible de rechercher jusqu'à 200 séquences cibles à la fois, à l'aide de méthodes d'alignement local ou global.
Image illustrant les deux types de recherche différents : avec ou sans requête séquentielle.
Deux options de recherche offrent une flexibilité optimale pour cibler les recherches en fonction d'objectifs spécifiques.  
  • Visualisez les tendances en matière de modifications : doté d'outils de visualisation robustes, Patsnap Bio permet aux utilisateurs d'explorer en toute simplicité la répartition des modifications chimiques dans leurs résultats de recherche. Ces outils facilitent l'extraction d'informations précieuses relatives aux séquences ou aux types de modifications recherchés, améliorant ainsi les processus décisionnels.
Gif montrant la page des résultats de recherche et un résumé visuel des principales tendances de modification au sein des séquences trouvées, à partir duquel vous pouvez accéder à des résultats spécifiques pour une analyse approfondie.  
La page des résultats fournit un résumé visuel des principales tendances de modification dans vos séquences de résultats, à partir duquel vous pouvez accéder à des résultats spécifiques pour une analyse approfondie.  
  • Analyse approfondie des sources : identifiez de nouvelles opportunités et évaluez la brevetabilité des inventions en accédant rapidement aux brevets correspondant à vos résultats de recherche et en examinant en détail les revendications de modification.
Flux de travail montrant la vue du brevet Patsnap et l'exploration des sources à partir desquelles les modifications de la séquence cible ont été récupérées, puis en cliquant dessus pour les afficher plus en détail.  
Chaque séquence de résultats affiche les sources à partir desquelles les modifications ont été récupérées. Il est possible de cliquer dessus pour obtenir plus de détails.  
  • Rapport de modification instantané : en un seul clic, générez des rapports exportables résumant la répartition des modifications détectées, ainsi qu'un résumé de toutes les autres modifications de séquence dans un ensemble de résultats. Ces rapports accélèrent l'identification et la compilation d'informations exploitables pour une analyse plus approfondie et la prise de décision.
Le rapport de recherche des modifications exportables résume la répartition des modifications trouvées ainsi que des autres modifications présentes dans les séquences trouvées.  
Le rapport de recherche des modifications exportables résume la répartition des modifications trouvées ainsi que des autres modifications présentes dans les séquences trouvées.  

Patsnap Bio : tracer l'avenir de l'innovation biothérapeutique 

Offrant des fonctionnalités et des informations inégalées sur le monde des séquences biologiques, Patsnap Bio inaugure une nouvelle ère d'efficacité et de précision dans le domaine de l'innovation biothérapeutique. 

Pour en savoir plus sur la nouvelle fonctionnalité de recherche par modification de Patsnap, réservez une démonstration pour la voir en action ou essayez Patsnap Bio gratuitement dès aujourd'hui.

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