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生物配列解析に革命を起こす: 初の修飾検索ツールの紹介

進化し続ける製薬とバイオテクノロジーの状況では、精度と効率が製品全体にわたって最も重要です。 研究開発 (研究開発)プロセス。生物学の急速な進歩に遅れを取らないようにするには、革新的なソリューションが不可欠です。  

この記事では、世界初の化学修飾検索ツールである Patsnap Bio の最新リリースと、それがどのように配列検索技術を改善し、効率化できるかについて詳しく説明します。 操作の自由 (FTO) 解析。

配列変更とは何ですか? 

配列修飾が中心となります 創薬 および 知的財産 (IP) 保護。これには、化学基を追加することによってタンパク質または核酸の配列を変更することが含まれます。 特定の地域、機能的な変化を引き起こします。蛍光標識、グリコシル化、リン酸化は、高いバイオアベイラビリティと標的特異性、半減期の延長、オフターゲット効果の低減など、最適な治療特性を達成するために利用できる多くの修飾技術のほんの一部です。配列修飾の複雑さを理解することで、研究者は複雑な治療法開発をより効果的に進めることができ、最終的には医学の最前線を前進させ、患者の転帰を改善することができます。   

米国特許第20180195070A1号「LPAの遺伝子発現を阻害するための組成物および方法」に記載されている修飾ヌクレオチド配列を示す画像。
特許に見られる修飾ヌクレオチド配列の例 US20180195070A1: LPAの遺伝子発現を阻害するための組成物および方法.
出典: Patsnap Bio

配列の特許性の確立

配列ベースの検索は、新しい配列の特許性を判断するために重要です。これらは、既存の知的財産環境をナビゲートし、潜在的な侵害リスクを正確に特定するのに役立ちます。のような分野で 核酸 技術を発展させるには、化学修飾の戦略的利用が不可欠です。これらの修飾は、オリゴヌクレオチドの有効性を最適化し、複雑な疾患に対処できる医薬品を作成するのに役立ちます。

その重要性にもかかわらず、特許における化学修飾の記述における標準化の欠如は、依然として明らかなギャップのままです。修飾に関する特許の説明は、多くの場合非常に個別的です。たとえば、2'-O-メチルと 2'-ome は両方とも rRNA の同じ修飾を示します。このため、従来の検索方法を使用する場合、関連する特許を検索することが困難になり、FTO 検索の精度が損なわれます。  

これを克服するには、研究者は労働集約的なさまざまな検索方法を利用する必要があります。これには、従来の配列検索と徹底的なキーワード検索を組み合わせて、修飾の潜在的なバリエーションをすべて捕捉することが含まれます。その後、各シーケンスの変更データを項目ごとに手動で注意深く確認する必要があります。  

パツスナップの略歴 は、AI を活用して、配列修飾データをより迅速かつ確実に収集および分析する方法をイノベーターに提供することで、これらの課題を解決します。新たに導入された修飾検索により、ユーザーはクエリ配列の有無にかかわらず、1.5 万を超える修飾配列のデータベースから抽出して部位固有の修飾を検索できます。この機能は、次のような重要な質問に対処します。 

  • この変更はどの程度広く使用されていますか?   
  • この修正を含む既存の先行技術はどれですか? 
  • 私のクエリに関連する他の変更は何ですか? 
ユーザーが希望するシーケンスの長さと変更の場所/タイプを入力する、patsnap のワークフローを示す GIF。
検索を開始するには、ユーザーは希望する配列の長さと修飾の場所/タイプを入力するだけです。必要に応じて、クエリ配列も使用できます。  

Patsnap Bio は、配列修飾データの包括的な検索と理解を容易にすることで、研究者、知財専門家、研究開発担当者が世界クラスの治療薬の設計と最適化に効果的にアプローチできるようにします。 

主な機能

  • 標準化された変更ライブラリ: Patsnap Bio は、高度な AI と細心の注意を払った手動キュレーションを活用して、配列修飾データを標準化されたライブラリに統合します。このデータには、化学修飾タイプの 382 つの主要カテゴリと XNUMX のサブカテゴリが含まれており、包括的なカバレッジが保証されています。 
  • 柔軟な検索オプション: Patsnap Bio の修飾検索は、配列ベースと配列フリーの両方の検索オプションを提供し、特定の修飾に関する傾向と洞察の特定を容易にします。配列ベースのクエリの場合、ローカルまたはグローバル アラインメント方法を使用して、最大 200 個のターゲット配列を一度に検索できます。
2 つの異なる検索タイプ (シーケンス クエリありまたはシーケンス クエリなし) を示す画像。
2 つの検索オプションにより、特定の研究目標に合わせて検索を行うための究極の柔軟性が提供されます。  
  • 変更の傾向を視覚化します。 堅牢な視覚化ツールを備えた Patsnap Bio を使用すると、ユーザーは検索結果内の化学修飾の分布をシームレスに調査できます。これらのツールは、クエリされたシーケンスまたは修飾タイプに関連する貴重な洞察の抽出を容易にし、意思決定プロセスを強化します。
検索結果ページとヒット シーケンス内の上位の変更傾向の視覚的な概要を示す GIF。そこから特定の結果を掘り下げて詳細な分析を行うことができます。
結果ページには、ヒット シーケンスの上位の変更傾向の視覚的な概要が表示され、そこから特定の結果を掘り下げて詳細な分析を行うことができます。  
  • 徹底的なソース分析: 検索結果に対応する特許に素早くアクセスし、修正クレームを詳しく調べることで、新たな機会を特定し、発明の特許性を評価します。
Patsnap の特許ビューを表示し、ヒット シーケンスの変更が取得されたソースにアクセスし、クリックして詳細を表示するワークフロー。
各ヒット シーケンスには、ヒット修正が取得されたソースが表示され、クリックすると詳細を表示できます。  
  • インスタント 修正レポート: ワンクリックで、要約したエクスポート可能なレポートを生成します。 ヒット修飾の分布、および結果セット内の他のすべての配列修飾の概要。これらのレポートにより、さらなる分析と意思決定のための実用的な洞察の特定と編集が促進されます。
エクスポート可能な修飾検索レポートには、ヒット修飾とヒット シーケンスに存在するその他の修飾の両方の分布が要約されます。
エクスポート可能な修飾検索レポートには、ヒット修飾とヒット シーケンスに存在するその他の修飾の両方の分布が要約されます。  

Patsnap Bio: バイオ医薬品イノベーションの未来を描く 

比類のない機能とバイオシーケンスの世界への洞察を提供する Patsnap Bio は、バイオ医薬品イノベーションの世界に効率と精度の新時代をもたらします。 

Patsnap の新しい改造検索について詳しくは、 デモを予約する 実際に動作している様子を見るか、 Patsnap Bio を無料で試してみる

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