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생물학적 서열 분석의 혁신: 최초의 변형 검색 도구 소개

끊임없이 진화하는 제약 및 생명공학 환경에서 정확성과 효율성은 모든 분야에서 가장 중요합니다. 연구 및 개발 (R&D) 프로세스. 생명과학의 급속한 발전에 보조를 맞추려면 혁신적인 솔루션이 필수적입니다.  

이 기사에서는 세계 최초의 화학적 변형 검색 도구인 Patsnap Bio의 최신 릴리스와 이것이 서열 검색 기술을 개선하고 간소화할 수 있는 방법을 살펴보겠습니다. 운영의 자유(FTO) 분석.

시퀀스 수정이란 무엇입니까? 

서열 변형이 핵심이다 신약 개발지적 재산권 (IP) 보호. 여기에 화학 그룹을 추가하여 단백질이나 핵산 서열을 변경하는 것이 포함됩니다. 특정 지역, 기능적 변화를 유도합니다. 형광 표지, 글리코실화 및 인산화는 높은 생체 이용률 및 표적 특이성, 연장된 반감기 및 감소된 표적 이탈 효과와 같은 최적의 치료 특성을 달성하는 데 사용할 수 있는 많은 변형 기술 중 일부에 불과합니다. 연구자들은 서열 변형의 복잡성을 이해함으로써 치료법 개발의 복잡성을 보다 효과적으로 탐색하여 궁극적으로 의학의 최전선을 발전시키고 환자 결과를 개선할 수 있습니다.   

특허 US20180195070A1: LPA의 유전자 발현을 억제하기 위한 조성물 및 방법에서 발견된 변형된 뉴클레오티드 서열을 보여주는 이미지.
특허에서 발견된 변형된 뉴클레오티드 서열의 예 US20180195070A1: LPA의 유전자 발현을 억제하기 위한 조성물 및 방법.
출처: Patsnap Bio

서열의 특허성 확립

서열 기반 검색은 새로운 서열의 특허 가능성을 결정하는 데 중요합니다. 이는 기존 IP 환경을 탐색하고 잠재적인 침해 위험을 정확히 찾아내는 데 도움이 됩니다. 같은 분야에서는 핵산 기술을 사용하려면 화학적 변형을 전략적으로 사용하는 것이 필수적입니다. 이러한 변형은 올리고뉴클레오티드의 효과를 최적화하여 복잡한 질병을 해결하는 데 사용할 수 있는 약물을 만드는 데 중요한 역할을 합니다.

그 중요성에도 불구하고 특허의 화학적 변형을 기술하는 데 있어 표준화가 부족하다는 점은 여전히 ​​큰 격차로 남아 있습니다. 변형에 대한 특허 설명은 종종 매우 개인주의적입니다. 예를 들어 2'-O-methyl과 2'-ome은 모두 rRNA의 동일한 변형을 나타냅니다. 이로 인해 기존 검색 방법을 사용할 때 관련 특허를 검색하는 데 어려움이 있으며 FTO 검색의 정확성이 저하됩니다.  

이를 극복하기 위해 연구자들은 노동 집약적인 다양한 검색 방법을 활용해야 합니다. 여기에는 기존의 시퀀스 검색과 철저한 키워드 검색을 결합하여 수정의 모든 잠재적 변형을 포착하는 것이 포함됩니다. 그런 다음 각 시퀀스의 수정 데이터를 항목별로 수동으로 꼼꼼하게 검토해야 합니다.  

팻스냅 바이오 AI를 활용하여 서열 변형 데이터를 보다 빠르고 자신 있게 선별하고 분석할 수 있는 방법을 혁신가에게 제공함으로써 이러한 문제를 해결합니다. 새로 도입된 수정 검색을 통해 사용자는 쿼리 시퀀스 유무에 관계없이 1.5만 개 이상의 수정된 시퀀스 데이터베이스에서 그림을 그려 사이트별 수정을 검색할 수 있습니다. 이 기능은 다음과 같은 필수 질문을 해결합니다. 

  • 이 수정 사항은 얼마나 널리 사용됩니까?   
  • 이 수정 사항을 포함하는 기존 선행 기술은 무엇입니까? 
  • 내 쿼리와 관련된 다른 수정 사항은 무엇입니까? 
사용자가 원하는 시퀀스 길이와 수정 위치/유형을 입력하는 patsnap의 워크플로를 보여주는 GIF입니다.
검색을 시작하려면 사용자는 원하는 시퀀스 길이와 수정 위치/유형을 입력하기만 하면 됩니다. 원하는 경우 쿼리 시퀀스를 사용할 수도 있습니다.  

Patsnap Bio는 서열 변형 데이터의 포괄적인 검색 및 이해를 촉진함으로써 연구원, IP 전문가 및 R&D 인력이 세계적 수준의 치료법의 설계 및 최적화에 효과적으로 접근할 수 있도록 지원합니다. 

주요 특징들

  • 표준화된 수정 라이브러리: Patsnap Bio는 고급 AI와 세심한 수동 큐레이션을 활용하여 서열 변형 데이터를 표준화된 라이브러리에 통합합니다. 이 데이터에는 화학적 변형 유형의 382개 주요 범주와 XNUMX개 하위 범주가 포함되어 있어 포괄적인 범위를 보장합니다. 
  • 유연한 검색 옵션: 서열 기반 검색 옵션과 서열 없는 검색 옵션을 모두 제공하는 Patsnap Bio의 변형 검색은 특정 변형을 둘러싼 추세와 통찰력을 쉽게 식별할 수 있습니다. 시퀀스 기반 쿼리의 경우 로컬 또는 전역 정렬 방법을 사용하여 최대 200개의 대상 시퀀스를 한 번에 검색할 수 있습니다.
두 가지 다른 검색 유형(순서 쿼리 포함 또는 없음)을 보여주는 이미지.
두 가지 검색 옵션은 특정 연구 목표에 대한 검색 대상을 지정할 수 있는 최고의 유연성을 제공합니다.  
  • 수정 추세 시각화: 강력한 시각화 도구를 갖춘 Patsnap Bio를 사용하면 사용자는 검색 결과 내에서 화학적 변형의 분포를 원활하게 탐색할 수 있습니다. 이러한 도구는 쿼리된 시퀀스 또는 수정 유형과 관련된 귀중한 통찰력을 추출하여 의사 결정 프로세스를 향상시킵니다.
심층 분석을 위해 특정 결과를 살펴볼 수 있는 검색 결과 페이지와 히트 시퀀스 내의 주요 수정 추세에 대한 시각적 요약을 보여주는 GIF입니다.
결과 페이지는 히트 시퀀스의 주요 수정 추세에 대한 시각적 요약을 제공하며, 여기에서 심층 분석을 위한 특정 결과를 살펴볼 수 있습니다.  
  • 심층적인 소스 분석: 검색 결과에 대한 해당 특허에 빠르게 액세스하고 수정 청구를 자세히 살펴봄으로써 새로운 기회를 식별하고 발명의 특허 가능성을 평가합니다.
Patsnap 특허 보기를 보여주고 히트 시퀀스 수정 사항이 검색된 소스를 자세히 살펴보고 해당 소스를 클릭하여 더 자세히 볼 수 있는 워크플로입니다.
각 히트 시퀀스에는 히트 수정이 검색된 소스가 표시되며 클릭하면 더 자세히 볼 수 있습니다.  
  • 즉시 수정 보고서: 단 한 번의 클릭으로 내보낼 수 있는 요약 보고서를 생성합니다. 적중 수정 분포 및 결과 세트 내의 기타 모든 시퀀스 수정 요약. 이러한 보고서는 추가 분석 및 의사 결정을 위해 실행 가능한 통찰력을 신속하게 식별하고 편집합니다.
내보낼 수 있는 수정 검색 보고서에는 적중 수정과 적중 시퀀스에 있는 기타 수정의 분포가 요약되어 있습니다.
내보낼 수 있는 수정 검색 보고서에는 적중 수정과 적중 시퀀스에 있는 기타 수정의 분포가 요약되어 있습니다.  

Patsnap Bio: 바이오치료제 혁신의 미래 차트 작성 

바이오시퀀스 세계에 대한 탁월한 기능과 통찰력을 제공하는 Patsnap Bio는 바이오치료제 혁신 세계에 효율성과 정확성의 새로운 시대를 도입하고 있습니다. 

Patsnap의 새로운 수정 검색에 대해 자세히 알아보려면 데모 예약 실제로 작동하는 모습을 보거나 Patsnap Bio를 무료로 사용해 보세요 .

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